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Genotyping für Kulturpflanzen

Für moderne Züchtungsprozesse sind genetische Analysen besonders wertvoll. An die dafür eingesetzten Genotypisierungs-Arrays werden eine Reihe von Anforderungen gestellt. Sie sollen:

Diese Punkte werden für unsere optimierten Genotypisierungs-Aaarys berücksichtigt, um Züchtern qualitativ hochwertige Daten für eine hohe Probenzahl bei geringen Kosten liefern zu können.

Für diese Kulturpflanzen bieten wir genetische Untersuchungen an

  • Weizen
  • Mais
  • Sojabohnen
  • Baumwolle
  • Brassica (Ölraps, Gemüse)
  • Gerste
  • Sonnenblume
  • Reis
  • Solanaceae (Tomate, Paprika, Kartoffel, etc.)
  • Cucurbitaceae (Gurke, Melone, Wassermelone, etc.)
  • Sonstige Pflanzen (z. B. Hafer, Roggen, Triticale, Erbse, Bohne, Weinrebe, Sorghum, Lolium, Blumenkohl, Karotte, Zwiebel, Salat, Spargel, Apfel, Kirsche, Erdbeere usw.)

Überblick über etablierte Genotyping Arrays

Technologische Plattformen für das Genotyping

Axiom Arrays

Die Axiom-Arrayplattform nutzen wir für Platten mit 96 und 384 Proben. Es werden hier hauptsächlich Genotypisierungen von großen Arrays mit mehr als 100.000 Markern durchgeführt. Auf diesem System bieten wir die Analyse aller öffentlich zugänglicher Arrays, sowie kunden-spezifischer Arrays an. Zusätzlich haben wir eine Reihe eigener großer Affymetrix-Arrays entwickelt, wie z.B.

  • Weizen 135K
  • 30-80K Arrays für alle wichtigenm Gemüsearten (Gurke, Melone, Wassermelone, Tomate, Salat, Zwiebel, Spargel, Karotte)

Illumina Arrays

Unsere Experten von TraitGenetics waren an der Entwicklung zahlreicher veröffentlichter Genotypisierungs-Arrays für Pflanzen beteiligt (z.B. Weizen, Gerste, Brassica, Baumwolle, Paprika, Tomate usw.). Wir nutzen die Illumina Infinium Genotypisierung für Hochdurchsatz-Anwendungen (HD, HTS, XT) für Markerzahlen zwischen 5.000 und 100.000.

In unseren molekularbiologischen Laboren arbeiten wir mit allen öffentlich verfügbaren Illumina-Pflanzen-Genotypisierungs-Arrays (z.B. für Feldfrüchte, Gemüse, Obst), nutzen aber auch eigenentwickelte, optimierte Genotypisierungs-Arrays für wichtige Nutzpflanzenarten. Diese wurden speziell auf Züchtungsanwendungen ausgerichtet.

SGS INSTITUT FRESENIUS GmbH - TraitGenetics Section

Am Schwabeplan 1b
06466 Stadt Seeland OT Gatersleben

t: +49 39482 79970